1992年10月，党的十四次全国代表大会在北京举行。为落实党的十四大精神，搞好学校的深化改革工作，学校党委先后七次开会讨论研究学校的改革问题，并组织教职工反复学习有关文件，提高对改革重大意义的认识，增强改革的自觉性。与此同时，学校主要领导带队，先后五次到南方及省内深化改革工作走在前列的高校取经，并把先进单位的改革经验向全校教职工传达，激发大家搞好学校改革的热情，提升紧迫感。在此基础上，学校四次召开全校教职工大会，发动群众，献计献策，研讨深化改革方案。
1992年11月，学校召开第三次科技大会。大会在总结经验的基础上，根据实际情况和科技工作进行改革的思路，制定了1993年至1995年科技发展规划。规划指出：学校的科技工作以应用研究为主，以开发医疗新技术为重点，重视有应用前景的基础研究。科技大会的召开，调动了科技人员的科研积极性。
《锦州医学院深化改革方案》经省级主管部门批准开始实行，此方案全面贯彻了党的基本路线和党的十四次全国代表大会精神，以建设有中国特色的社会主义理论为指针，大胆解放思想，转变观念，实事求是，勇于探索，主动适应加快改革开放和现代化建设的需要，积极适应社会主义市场经济体制和政治、文化体制改革以及加快高等教育发展的要求。改革方案从四个方面推进了学校改革工作的发展：一是以人事分配制度为主的内部管理体制改革，提出以定编、定岗、定责“三定”为突破口的人事分配制度改革方案；二是教育教学内容的改革；三是关于科技工作的改革；四是关于后勤工作的改革。《锦州医学院深化改革方案》的实施，有力地推动了学校深化改革的进程。
